O DIAP de Lisboa e a Marinha Portuguesa firmaram um Protocolo de cooperação em matéria de formação recíproca, com incidência em temas relacionados com informação e prevenção da criminalidade militar e temas específicos de recursos humanos (língua inglesa, liderança e equipa). Recorda-se que o DIAP de Lisboa tem competência para a investigação dos crimes militares ocorridos nos Distritos Judiciais de Lisboa e Évora.